後來他被貶為中大夫，居家寫作了《災異之記》。

這時遼東高帝廟發生火災，主父偃嫉妒他，就竊取了他的書上奏天子。

天子召集衆儒生把書拿給他們看，儒生們認為其中含有指責譏諷朝政之意。

董仲舒的學生呂步舒不知道這是自己老師的著作，認為它愚蠢至極，于是把董仲舒交法官論罪，判處死刑，但是皇上降诏赦免了他。

于是董仲舒始終不敢再講論災異之說。

董仲舒為人廉潔正直。

這一時期朝廷正用兵向外排除四方邊境内外少數民族的侵擾，公孫弘研究《春秋》成就不及董仲舒，但是他行事善于迎合世俗，因此能身居高位做了公卿大臣。

董仲舒認為公孫弘為人阿谀逢迎。

公孫弘憎恨他，就對皇上說：“隻有董仲舒可以擔當膠西王的國相。”

膠西王為人狠毒暴戾，但是一向聽說董仲舒有美德，也很好地禮遇他。

董仲舒害怕居官日久會惹禍上身，就稱病辭官回家。

直至逝世，他始終不曾營治私産，而一心以研究學問寫作論著為本職。

所以自漢朝開國以來曆經五朝，期間隻有董仲舒對《春秋》最為精通，名望甚高，他師承傳授的是《春秋》公羊學。

胡毋生，是齊郡人。

孝景帝時拜為博士，後因年老返歸故裡講授《春秋》。

齊地解說《春秋》的人很多受教于胡毋生，公孫弘也受過他的教誨。

瑕丘人江生研究《春秋》谷粱學。

自從公孫弘受到重用，他曾收集比較了谷粱學和公羊學的經義，最後采用了董仲舒所傳授的公羊氏的學說。

董仲舒的弟子中有成就的人是：蘭陵人褚大，廣川人殷忠，溫人呂步舒。

褚大官至粱王國相。

呂步舒官至長史，手持符節出使去決斷淮南王劉安謀反的罪案，對諸侯王敢于自行裁決，而不加請示。

他根據《春秋》經義公正斷案，天子都認為很對。

弟子中官運通達的，做到了大夫之職；谒者、掌故的則有百餘人。

而董仲舒的兒子和孫子也都因精通儒學做了高官。